Les différentes activités et périmètre du poste :

• Analyse en génomique comparative, identification d’espèces
• Assemblage, orfing et annotation de données issues de séquençage à haut-débit
• Détection de variations constitutionnelles et somatiques à partir de données de séquençage à haut-débit
• Développement des logiciels, scripts et interfaces nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales
• Développement de pipelines d’analyse, de méthodes d’automatisation des analyses
• Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d’activité
• Mise en place de bases de données moléculaires
• Conseil aux décideurs concernant les choix, les projets, les activités du domaine d’activité
• Définition des prototypages et jeux d’essai
• Définition et réalisation d’interfaces homme-machine
• Identification de marqueurs génomiques de résistance aux antimicrobiens, de virulence ...
• Développement des progiciels et programmation nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales incluant le développement de Pipelines d'analyse bio-informatique des données issues du séquençage haut débit (NGS)
• Savoir utiliser les outils, plateformes et pipelines d’analyses bioinformatiques déjà en place
• Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application
• Participation à la rédaction de publications scientifiques et médicales
• Participation et présentation de travaux dans des congrès scientifiques
• Recensement et analyse des besoins des utilisateurs, spécifiques à son domaine
• Traitement et analyse de l’information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique
• Veille scientifique et professionnelle
• Prise en compte des enjeux de développement durable dans le cadre de l’application des missions

Vous avez un master en bioinformatique ou un diplôme d'école d'ingénieurs (INSA Lyon, ISBS...) ?

Vous avez une formation en biologie ou en biochimie ?

Vous disposez de connaissances approfondies en biologie moléculaire ?

Alors n'hésitez plus, postulez !

Les petits + :

• Accès à l’ensemble du Plan de formation, très fourni (5 millions € par an dédiés à la formation)
• Accès aux selfs du CHU, possibilité de demander des places de crèche du CHU
• Accès au CGOS : vacances à prix réduit, tarifs préférentiels sur des spectacles, parc d’attractions, chèque culture, chèques vacances, etc.
• Prise en charge de 75% de l’abonnement de transport en commun
• Ateliers bien-être et salle de sport accessibles gratuitement